标题:恢复蛋白EF—hand与钙离子去耦合作用的拉伸分子动力学模拟
作者:李吉来[1,2];耿彩云[2];步宇翔[1];张亮[1];张来斌[1];黄旭日[2];孙家锺[2]
作者机构:[李吉来] 山东大学化学与化工学院, 胶体与界面化学教育部重点实验室,理论化学计算国家重点实验室, 济南, 山东 250100, 中国.;[耿彩云] 吉林大学理论化学研究所, 更多
通讯作者:Huang, X(tcclab@gmail.com)
通讯作者地址:[Li, JL]Shandong Univ, Key Lab Educ Minist Colloid & Interface Chem, Jinan 250100, Peoples R China.
来源:化学学报
出版年:2009
卷:67
期:14
页码:1597-1602
关键词:恢复蛋白;变构过程;信号传导;去耦合作用;拉伸分子动力学;Ca^2+/豆蔻酰基开关;
摘要:恢复蛋白Recoverin是一重要的神经钙传感蛋白.为澄清EF—hand与Ca^2+耦合/去耦合作用机制,采用拉伸分子动力学(SMD)方法对其进行了一系列等外力和等速度的非平衡分子动力学模拟.研究结果表明EF-2和EF-3 loop区氨基酸螯合Ca^2+能力大小顺序分别为Asn-76〈Thr-80〈Glu-85〈Asp-74〈Asp-78和Thr-116〈Glu-121〈Asp-110〈Asn-114〈Asp-112.结构域EF-3比EF-2耦合Ca^2+离子的能力强.EF—handloop环中的Asp-78和Asp-112残基在该信号传导过程中起至关重要的作用.基于理论模拟和试验结果我们推测Ca^2+离子诱导恢复蛋白的构象转变是一个两步过程.在该细胞信号Ca^2+离子与恢复蛋白耦合过程中,EF.3和Ca^2+耦合作用触发恢复蛋白构象转变,而EF-2和Ca^2+的耦合作用起续航作用,促使变构过程完成.
收录类别:CSCD;SCOPUS;SCIE
资源类型:期刊论文
原文链接:https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-84884678207&partnerID=40&md5=80058ddf7da76547b65dc767cdd13400
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