标题:人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析
作者:刘晓林;陶泽新;王海岩;刘尧;宋立志;纪峰;王同展;林小娟;王素婷;徐爱强
作者机构:[刘晓林] 山东大学公共卫生学院, 济南, 山东 250012, 中国.;[陶泽新] 山东省疾病预防控制中心, 山东省传染病预防控制重点实验室, 济南, 山东 250014, 中国.;[王海 更多
通讯作者:Liu, XL(190165446@qq.com)
来源:病毒学报
出版年:2013
卷:29
期:4
页码:398-403
关键词:人类肠道病毒74型; 基因组; 重组; 急性弛缓性麻痹
摘要:人类肠道病毒(HEV)74型是人类肠道病毒B组(HEV-B)的新成员。为了解其进化和重组特性,本研究对2005年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的人类肠道病毒74型山东地方株05293/SD/CHN/2005进行了全基因组序列测定和分析。与Gen Bank中的另2株HEV74全基因组序列比对,发现在5NTR和3NTR区有核苷酸缺失和插入;核苷酸序列的同源性分别为80.8%和80.6%,氨基 酸同源性为96%和95.9%。山东株与原型株USA/CA75-10213间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.5%、80.0%和79.7% ,氨基酸同源性分别为95.9%、96.0%和96.2%;山东株与西藏株Rikaze-136间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.9%、78 .8%和79.5%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.1%和95.7%。通过系统发生树和同源重组分析,发现该病毒可能与其他HEV-B组肠道病毒 间发生重组。
收录类别:CSCD;SCOPUS
资源类型:期刊论文
原文链接:https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-84902924136&partnerID=40&md5=d8e03f72ef2149104908957c96832967
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