标题:肠道病毒71型山东临沂分离株全基因组序列分析
作者:温红玲;郝树彬;高峰;赵丽;司鲁莹;袁晓晶;王东旭;王志玉
作者机构:[温红玲] 山东大学公共卫生学院病毒学研究室, 实验畸形学教育部重点实验室, 济南, 山东 250012, 中国.;[赵丽] 山东大学公共卫生学院病毒学研究室, 实验畸形学教育 更多
通讯作者:Wang, ZY(zhiyu.wang@sdu.edu.cn)
通讯作者地址:[Wang, Z.-Y] Department of Virology, School of Public Health, Shandong University, Jinan 250012, China;
来源:中华微生物学和免疫学杂志
出版年:2011
卷:31
期:7
页码:603-608
DOI:10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2011.07.007
关键词:手足口病; 肠道病毒71型; 序列分析
摘要:目的自1例死亡患儿的标本中分离EV71,并分析其全基因组序列特点,研究其基因序列的改变是否与其神经毒力有关。方法咽拭子标本采自山东临沂市人民医院 1例死亡患儿,在人横纹肌瘤细胞(RD)上分离EV71,分段扩增获得EV71的全序列,用BLAST、Bioedit和MEGA4进行序列分析。结果获 得1株EV71分离株SDLY107,基因组全长7405bp,全基因组核苷酸序列与2008年的阜阳株Fuyang.Anhui.P.R.C/17.0 8/2同源性最高,为98.6%,与原型株BrGr/70的同源性为80.0%,与神经毒型株MS/87的同源性为86.5%。系统进化分析表明,SDL Y107与中国大陆的北京株、河南株、广西株、深圳株、兰州株、阜阳株、重庆株、浙江株的亲缘关系较近,按照传统的VP1基因分型方法,可归为C4亚型, 是近年来我国大陆流行的主要基因亚型。氨基酸序列分析发现,SDLY107与其他毒株相比,有2个特有的突变(E947D,K1873R)。结论SDLY 107分离株属于C4亚型,氨基酸突变E947D和K1873R可能与EV71的致病性有关。
收录类别:CSCD;SCOPUS
Scopus被引频次:2
资源类型:期刊论文
原文链接:https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-84874987979&doi=10.3760%2fcma.j.issn.0254-5101.2011.07.007&partnerID=40&md5=c19dfe7399d753bef9ae5030c057c546
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