标题:基于宏基因组数据的微生物群落比较方法
作者:常秦;黎珊;
作者机构:[常秦;黎珊]山东大学数学学院
来源:科学技术与工程
出版年:2013
期:09
页码:2457-2464
DOI:10.3969/j.issn.1671-1815.2013.09.028
关键词:宏基因组;;16S rRNA;;全基因组测序;;群落比较;;系统发生树
摘要:宏基因组学是一门研究直接来自环境的基因材料的新兴学科。传统的微生物学研究,依赖于实验室培养,而宏基因组学,使得对这些未被培养或不可培养的微生物的研究成为可能,也为同一环境中微生物之间相互作用的研究,以及微生物群落的整体研究,指明了新的方向。随着测序技术的迅速发展,大量宏基因组测序数据不断产生,对新的统计分析方法提出了更高的要求。简要介绍了宏基因组学以及其中的几个重要问题,主要针对其中基于测序数据的群落比较问题进行论述,介绍了多种现今常用的统计计算方法,并分析了它们的适用情况。
资源类型:期刊论文
原文链接:http://kns.cnki.net/kns/detail/detail.aspx?FileName=KXJS201309029&DbName=CJFQ2013
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