标题:克山病与扩张型心肌病的IncRNA-mRNA共表达对比研究
作者:黄广勇; 相有章; 刘静雯; 王月海; 王静; 曹苗苗; 王学松; 种冠峰; 杨文波
作者机构:[黄广勇]山东大学附属聊城市人民医院心内科, 252000;[王月海]山东大学附属聊城市人民医院心内科, 252000;[曹苗苗]山东大学附属聊城市人民医院心内科, 252000;[相 更多
来源:中华地方病学杂志
出版年:2019
卷:38
期:5
页码:361-367
关键词:克山病; 扩张型心肌病; 转录组测序技术
摘要:目的构建克山病、扩张型心肌病患者外周血血浆的IncRNA/mRNA差异性表达谱,探讨两种疾病在分子机制方面的共性及特性。方法在山东省克山病重病区; 抽取10例慢型克山病患者,同时在山东省非克山病地区选取10例扩张型心肌病患者及10例健康者(对照组)。采集肘静脉血,分离血浆,应用转录组测序技术; (RNA-seq)构建克山病与对照组、扩张型心肌病与对照组的差异IncRNA/mRNA表达谱,通过维恩分析获得在克山病与扩张型心肌病中共同表达及; 特异表达部分基因,构建克山病特有部分、扩张型心肌病特有部分及两种疾病共有部分的IncRNA-mRNA共表达网络图,行Gene Ontology; (GO)功能分析和Kyoto Encyclopedia of Genes and; Genomes(KEGG)通路分析。结果将克山病、扩张性心肌病组的IncRNA/mRNA表达谱分别与对照组进行差异表达分析,发现102条mRNA; s及22条IncRNAs在两种疾病中差异表达趋势相同,3; 606条mRNAs及451条IncRNAs仅在克山病组差异表达,217条mRNAs及137条lncRNAs仅在扩张型心肌病组差异表达。生物信息技; 术分析显示,两病共同差异表达IncRNA/mRNA主要参与病毒转录、免疫-炎症反应、氧化应激反应等相关信号通路;克山病特异差异表达IncRNA/; mRNA主要参与细胞膜损害、病毒性心肌炎等生物学过程;而扩张型心肌病特异差异表达IncRNA/mRNA与调控线粒体的结构、氧化磷酸化过程相关酶的; 活性等有关。结论克山病与扩张型心肌病共同差异表达IncRNA/mRNA主要参与病毒转录、氧化应激等信号通路;克山病特异IncRNA/mRNA与细; 胞膜损害、病毒感染等有关;扩张型心肌病特异IncRNA/mRNA与线粒体结构等调控有关。
收录类别:CSCD
资源类型:期刊论文
TOP