标题:引起某禽类养殖场疫情的H3N2亚型流感病毒全基因组进化分析
作者:徐春雪; 刘伟; 焦伯延; 王震; 刘倜; 孙林; 张钦凤; 王显军
作者机构:[徐春雪]泰山医学院;;山东省疾病预防控制中心山东大学预防医学研究院, ;;山东省传染病重点实验室, 泰安;;济南, ;; 271000;;250014;[张钦凤]泰山医学院;;山东省 更多
来源:中华实验和临床病毒学杂志
出版年:2018
卷:32
期:4
页码:367-372
关键词:甲型流感; 暴发; 基因序列; 抗原分析
摘要:目的了解某禽类养殖场工人间的1起流感样病例暴发疫情的流行病学特点,确定疫情性质,分析流感病毒是否存在变异或基因重组,试阐述流感病毒来源。方法采用; 个案调查等流行病学调查方法开展现场调査,采集所有流感样病例咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离;对分离到的病毒进行全基因组测序,运用EditSeq和; MEGA5.05软件进行序列比对和进化分析。结果此次暴发疫情共报告流感样病例15例,罹患率为34.88%; ,核酸检测阳性率73.33%,分离到季节性A; (H3N2)型流感病毒5株。进化分析显示分离到的H3N2流感病毒的8个基因片段均与20152016年流感疫苗株处于同一分支上,没有发生与禽或猪流; 感病毒的基因重组。5株流感病毒的血凝素(HA)有14个氨基酸位点发生了替换,其中8个位于抗原决定簇上;对神经氨酸酶基因和基质蛋白基因进行氨基酸推; 测分析显示,所有流感病毒均对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,对M2离子通道抑制剂药物耐药。糖基化位点分析显示,NA新增两个糖基化位点NRT151-15; 3、NAT245-247,其余基因未变。结论此次暴发疫情为一起季节性A(H3N2)型流感病毒暴发,病毒发生了抗原漂移,未发现与禽流感、猪流感病毒; 基因重组的现象。
收录类别:CSCD
资源类型:期刊论文
原文链接:http://lib.cqvip.com/qk/97594X/201804/676156659.html
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