标题:2007-2011年青岛地区H3N2流感病毒全基因组进化特征分析
作者:汪照国;杨婷婷;柴青;刘晓琳;弋英;杨宇;于萍;王志玉
作者机构:[汪照国] 山东省青岛市疾病预防控制中心微生物与寄生虫检验科, 青岛, 山东 266033, 中国.;[杨婷婷] 山东省青岛市疾病预防控制中心微生物与寄生虫检验科, 青岛, 山 更多
来源:中华预防医学杂志
出版年:2013
卷:47
期:1
关键词:流感病毒A型; 人; 基因组; 抗原变异; 进化
摘要:目的了解2007-2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒的全基因组进化特征。方法选取2007-2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒58株, 提取病毒RNA,应用RT - PCR扩增各基因片段,并进行序列测定;用Sequencher软件完成序列拼接。选取GenBank收录的全球同期氨基酸数大于300的H3N2流感病 毒589株,以其血凝素重链区(HA1)序列作为参照,用Mega 5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。结果2007-2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒血凝素(HA)基因在进化树上形成单一 主干,每一流行季毒株的起源均晚于上一季;全基因组进化分析发现,2009-2010流行季存在重配病毒株,而2010-2011流行季同时存在簇I和簇 D两系毒株流行,该季病毒呈现复杂的重配现象。病毒HA1蛋白与疫苗株比较,2007-2011年各监测季分别有8、6、6、8、11处氨基酸变异,涉及 13个抗原位点。M2蛋白氨基酸序列分析表明,分离到的H3N2流感病毒31位氨基酸均发生丝氨酸->天冬酰胺(S31N)突变。2007-2011年青 岛地区分离的H3N2流感病毒HA1基因在进化树上与全球同期H3N2流感毒株处于同一主要分支。序列比对及抗原性分析显示,毒株A/Qingdao/F 521/2011存在H3N2与甲型H1N1流感病毒共感染现象。结论2007-2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒各基因片段呈现复杂的进化特征 。
收录类别:CSCD
资源类型:期刊论文
原文链接:http://lib.cqvip.com/qk/92392X/201301/44857790.html
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