标题:纳他霉素高产菌株Streptomyces gilvosporeus F607基因组及其生物合成基因簇分析
作者:付加芳; 张晶; 张严洁; 杨纯; 曹广祥; 宗工理
作者机构:[付加芳]山东省医药生物技术研究中心山东第一医科大学(山东省医学科学院), 济南, 山东 250062, 中国;[曹广祥]山东省医药生物技术研究中心山东第一医科大学(山东省 更多
来源:微生物学通报
出版年:2019
卷:46
期:9
页码:2312-2325
关键词:褐黄孢链霉菌; 纳他霉素生物合成基因簇; 次级代谢
摘要:【背景】纳他霉素(Natamycin)是一种天然、广谱、高效的多烯大环内酯类抗真菌剂,褐黄孢链霉菌(Streptomyces; gilvosporeus)是一种重要的纳他霉素产生菌。目前S.gilvosporeus基因组序列分析还未有报道,限制了该菌中纳他霉素及其他次级代; 谢产物合成及调控的研究。【目的】解析纳他霉素高产菌株S.gilvosporeus; F607的基因组序列信息,挖掘其次级代谢产物基因资源,为深入研究该菌株的纳他霉素高产机理及生物合成调控机制奠定基础。【方法】利用相关软件对F60; 7菌株的基因组序列进行基因预测、功能注释、进化分析和共线性分析,并预测次级代谢产物合成基因簇;对纳他霉素生物合成基因簇进行注释分析,比较分析不同; 菌种中纳他霉素生物合成基因簇的差异;分析预测S.gilvosporeus F607中纳他霉素生物合成途径。【结果】F607菌株基因组总长度为8; 482 298 bp,(G+C)mol%为70.95%,分别在COG、GO、KEGG数据库提取到5 062、4 428、5; 063个基因的注释信息。同时,antiSMASH软件预测得到29个次级代谢产物合成基因簇,其中纳他霉素基因簇与S.natalensis、S.ch; attanoogensis等菌株的纳他霉素基因簇相似性分别为81%和77%。除2个参与调控的sngT和sgnH基因和9个未知功能的orf基因有差; 异外,S.gilvosporeus; F607基因簇中其他纳他霉素生物合成基因及其排列顺序与已知的纳他霉素基因簇高度一致。【结论】分析了S.gilvosporeus全基因组信息,预测; 了S.gilvosporeus F607中纳他霉素生物合成的途径,为从基因组层面上解析S.gilvosporeus; F607菌株高产纳他霉素的内在原因提供了基础数据,为揭示纳他霉素高产的机理及工业化生产和未来新药的发现奠定了良好的基础。
收录类别:CSCD
资源类型:期刊论文
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